Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Vmn1r40-202ENSMUST00000226925 3011 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Cntn2-201ENSMUST00000086521 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Fnbp1-201ENSMUST00000073879 8469 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Kcnd2-201ENSMUST00000081542 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Tbx22-203ENSMUST00000168174 5217 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Acsl6-204ENSMUST00000093106 5804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Myh15-201ENSMUST00000168680 6340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Gm23459-201ENSMUST00000083259 131 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Pcm1-201ENSMUST00000045218 6624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Slc5a9-202ENSMUST00000102720 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Tbc1d24-205ENSMUST00000168378 4350 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Gm37022-201ENSMUST00000192517 2254 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Fam90a1b-203ENSMUST00000113903 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Bloc1s1-202ENSMUST00000131271 475 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Gm25605-201ENSMUST00000158364 124 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Gm18587-201ENSMUST00000213736 841 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Olfr1497-201ENSMUST00000061993 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 2410089E03Rik-201ENSMUST00000110617 10469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Exoc5-207ENSMUST00000162175 12699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Gm37924-201ENSMUST00000195470 3647 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Zfp661-201ENSMUST00000077422 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Gm37084-201ENSMUST00000191688 5898 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Pcdh11x-201ENSMUST00000050239 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Gm28704-201ENSMUST00000186589 2169 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Gm29636-201ENSMUST00000188149 2169 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 n-R5s82-201ENSMUST00000104213 109 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 4930558G05Rik-201ENSMUST00000122848 494 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Ube2d4-201ENSMUST00000075109 406 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Enah-211ENSMUST00000193703 11229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Slco5a1-207ENSMUST00000188454 8463 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PtprtQ99M80 Arl15-201ENSMUST00000091201 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Olfr943-202ENSMUST00000213176 8275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.1 ms