Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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Top1mtQ8R4U6 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Top1mtQ8R4U6 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Top1mtQ8R4U6 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Top1mtQ8R4U6 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Top1mtQ8R4U6 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Top1mtQ8R4U6 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Top1mtQ8R4U6 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Top1mtQ8R4U6 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Top1mtQ8R4U6 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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