Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDR2

Rsph6a, Radial spoke head protein 6 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph6aQ8CDR2 Vmn2r-ps43-201ENSMUST00000173798 2473 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rsph6aQ8CDR2 Gm3665-201ENSMUST00000177214 2461 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rsph6aQ8CDR2 Vmn2r-ps51-201ENSMUST00000177271 2461 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rsph6aQ8CDR2 Olfr119-202ENSMUST00000213732 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rsph6aQ8CDR2 Akap2-206ENSMUST00000107598 6830 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rsph6aQ8CDR2 Mbd4-201ENSMUST00000032469 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Bbs9-210ENSMUST00000147712 3495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Perm1-201ENSMUST00000105572 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Epb41-201ENSMUST00000030739 6565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Cdh16-201ENSMUST00000163783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Slc26a1-201ENSMUST00000051757 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Olfr822-202ENSMUST00000216879 2663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Satb1-203ENSMUST00000129667 2896 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm42700-201ENSMUST00000199071 2437 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm22927-201ENSMUST00000104268 131 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm14766-201ENSMUST00000121689 367 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm22915-201ENSMUST00000157615 136 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm25434-201ENSMUST00000158278 167 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 4933433F19Rik-201ENSMUST00000180571 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Mir6411-201ENSMUST00000183556 108 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm27401-201ENSMUST00000184052 173 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Mocs2-212ENSMUST00000184214 551 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Mir6409-201ENSMUST00000184957 92 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Mir7005-201ENSMUST00000185089 69 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Il19-203ENSMUST00000187410 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm28763-201ENSMUST00000188870 166 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 4930533P14Rik-201ENSMUST00000189056 583 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm29579-201ENSMUST00000190820 166 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm43023-201ENSMUST00000197583 2106 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm5581-202ENSMUST00000204992 714 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Olfr198-201ENSMUST00000064452 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm10123-201ENSMUST00000075723 490 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Ugt3a2-201ENSMUST00000072403 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Ucp2-202ENSMUST00000126534 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Olfr156-204ENSMUST00000215406 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Rab43-201ENSMUST00000032134 4308 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Hecw2-203ENSMUST00000120904 11263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Olfr1246-202ENSMUST00000213221 5338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Olfr1246-203ENSMUST00000217192 5301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Cndp1-201ENSMUST00000070139 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Adgrf4-204ENSMUST00000170723 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Nif3l1-202ENSMUST00000114337 2168 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Olfr172-202ENSMUST00000214139 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Mtrf1-201ENSMUST00000022600 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm7269-201ENSMUST00000210819 1373 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Mtf1-201ENSMUST00000030723 7631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Lcorl-201ENSMUST00000016026 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Ccnyl1-201ENSMUST00000094898 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Synj2-201ENSMUST00000061091 4072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Zic4-201ENSMUST00000066384 3891 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Plekhh1-204ENSMUST00000219956 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Eapp-206ENSMUST00000163433 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Edar-201ENSMUST00000003312 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Oas1e-203ENSMUST00000201172 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Cts7-203ENSMUST00000224986 1349 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm35172-201ENSMUST00000196037 2649 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Nedd4-209ENSMUST00000184450 3329 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm14305-203ENSMUST00000108983 1497 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm2026-202ENSMUST00000109008 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm4724-202ENSMUST00000109046 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm4631-201ENSMUST00000109050 1494 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm14434-203ENSMUST00000122097 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm11007-202ENSMUST00000178120 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm2007-202ENSMUST00000178133 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm11007-203ENSMUST00000185834 1494 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm2007-203ENSMUST00000189494 1494 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm18259-201ENSMUST00000220991 2010 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Birc2-202ENSMUST00000074246 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Nfat5-214ENSMUST00000169453 13380 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm23323-201ENSMUST00000104471 133 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm23527-201ENSMUST00000104570 130 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Olfr1396-202ENSMUST00000109201 1170 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms