Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm44768-201ENSMUST00000205719 393 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Olfr121-201ENSMUST00000074555 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Mapk10-202ENSMUST00000112846 2617 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Pcnx4-201ENSMUST00000044352 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm4617-201ENSMUST00000178993 331 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm13024-201ENSMUST00000121756 718 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 AC166574.1-201ENSMUST00000226916 1309 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ube2q1Q7TSS2 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms