Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44091-201ENSMUST00000205212 649 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8526-201ENSMUST00000079153 475 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Dennd6a-203ENSMUST00000224111 2692 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18632-201ENSMUST00000222597 2087 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37937-201ENSMUST00000194130 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm12066-201ENSMUST00000123592 443 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Dtna-202ENSMUST00000115832 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp870-201ENSMUST00000178401 5126 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
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Ccdc88cQ6VGS5 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Slc5a7-201ENSMUST00000095712 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
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Ccdc88cQ6VGS5 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Exoc4-201ENSMUST00000052266 4824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Stard9-201ENSMUST00000070420 4874 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Fam60a-211ENSMUST00000204435 2785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 E330013P04Rik-203ENSMUST00000190698 2996 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
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