Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm12244-201ENSMUST00000119500 291 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm25246-201ENSMUST00000175476 69 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 March1-204ENSMUST00000110253 2748 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Olfr1232-203ENSMUST00000215679 2389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 AC135669.2-201ENSMUST00000215636 4958 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Olfr788-201ENSMUST00000056961 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Gml2-201ENSMUST00000096399 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Zbbx-201ENSMUST00000039269 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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