Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm29282-201ENSMUST00000190720 473 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 4930518I17Rik-201ENSMUST00000203902 656 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Olfr153-201ENSMUST00000217113 1258 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 AC147615.1-201ENSMUST00000218914 441 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm19073-201ENSMUST00000219978 555 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Olfr1160-201ENSMUST00000099839 960 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm3278-201ENSMUST00000164459 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Arhgef3-202ENSMUST00000224981 3618 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Asxl2-201ENSMUST00000092003 11934 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm37060-201ENSMUST00000194997 2397 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Olfr678-202ENSMUST00000213622 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm42674-201ENSMUST00000107330 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm15275-201ENSMUST00000154752 347 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm25117-201ENSMUST00000157194 144 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm22226-201ENSMUST00000157355 109 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm26895-201ENSMUST00000181295 619 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm44830-201ENSMUST00000207667 584 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 AC159476.2-201ENSMUST00000216221 418 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Fam60a-211ENSMUST00000204435 2785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms