Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Ttc16-201ENSMUST00000066478 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gfm2-209ENSMUST00000161825 4416 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm29162-202ENSMUST00000188893 1499 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Heatr5b-201ENSMUST00000097281 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Plec-221ENSMUST00000171562 14944 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Plec-204ENSMUST00000072692 14944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Cdhr2-201ENSMUST00000037145 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Sycp2l-201ENSMUST00000124093 2641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Zfp942-202ENSMUST00000091879 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Crebbp-205ENSMUST00000205765 7749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Igkv12-89-201ENSMUST00000103335 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Xlr5a-202ENSMUST00000114520 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm12687-201ENSMUST00000119752 706 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm13788-201ENSMUST00000120767 601 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm15351-203ENSMUST00000153095 406 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Oas1h-202ENSMUST00000171820 931 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm24923-201ENSMUST00000178201 88 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm26746-201ENSMUST00000181722 487 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm37603-201ENSMUST00000192368 219 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm43657-201ENSMUST00000200336 3833 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 AC132437.1-201ENSMUST00000218308 320 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 AC124826.1-201ENSMUST00000221651 325 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Olfr906-201ENSMUST00000045493 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1369-ps1-201ENSMUST00000079050 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Mir185-201ENSMUST00000083530 65 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Vnn1-201ENSMUST00000041416 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm37549-201ENSMUST00000194096 4065 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Trhr-202ENSMUST00000110289 1745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Mark3-206ENSMUST00000221459 2807 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm35725-201ENSMUST00000221862 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Btbd11-202ENSMUST00000105306 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Tmcc3-202ENSMUST00000117460 3217 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm44848-201ENSMUST00000207808 3234 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Lamp2-202ENSMUST00000061755 3604 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Dsg3-201ENSMUST00000070892 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Cep95-202ENSMUST00000103068 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm30373-201ENSMUST00000215774 3500 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm43336-201ENSMUST00000200487 4504 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm26809-201ENSMUST00000180863 2981 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Faf2-203ENSMUST00000126071 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Hrh1-204ENSMUST00000161220 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Atp6ap2-201ENSMUST00000033313 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Ints10-202ENSMUST00000070713 4192 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Cth-201ENSMUST00000118539 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm28447-202ENSMUST00000186677 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Zp2-201ENSMUST00000033207 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Vps11-201ENSMUST00000034644 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Vps8-205ENSMUST00000118138 3060 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Plppr1-201ENSMUST00000076670 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Pclaf-201ENSMUST00000045802 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Smoc1-202ENSMUST00000110347 3496 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Prl-202ENSMUST00000110369 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm12607-201ENSMUST00000120724 493 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm12517-201ENSMUST00000122082 425 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm22208-201ENSMUST00000122658 110 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 A630023P12Rik-202ENSMUST00000141420 495 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm26349-201ENSMUST00000157530 130 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm21312-202ENSMUST00000180889 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm21304-202ENSMUST00000181059 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm8764-202ENSMUST00000181179 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm6763-202ENSMUST00000181287 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm21293-203ENSMUST00000181634 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm20765-202ENSMUST00000181703 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 1700020D05Rik-201ENSMUST00000189704 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm43711-201ENSMUST00000195994 373 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Zfp813-ps-202ENSMUST00000204773 618 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Mir129-2-201ENSMUST00000083577 90 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Ak6-202ENSMUST00000084721 1222 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.6 ms