Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Ppp1r2-ps9-201ENSMUST00000173100 549 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm23639-201ENSMUST00000175078 132 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm28117-201ENSMUST00000188472 371 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm38061-201ENSMUST00000192490 365 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm37871-201ENSMUST00000194973 688 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm9375-201ENSMUST00000208899 903 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm30132-202ENSMUST00000212825 819 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 B230303A05Rik-202ENSMUST00000220728 478 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 AC154552.5-201ENSMUST00000222352 207 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Stfa1-201ENSMUST00000042097 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Olfr952-201ENSMUST00000073895 1056 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Olfr877-201ENSMUST00000086063 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Olfr115-202ENSMUST00000221552 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Olfr115-203ENSMUST00000223366 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm14406-202ENSMUST00000108945 1348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Akt3-201ENSMUST00000019843 1511 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Olfr150-202ENSMUST00000217257 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 P2ry14-201ENSMUST00000065220 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Fxyd1-203ENSMUST00000108110 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm12306-201ENSMUST00000117256 171 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Olfr1171-ps1-201ENSMUST00000118079 837 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Vmn1r-ps99-201ENSMUST00000120067 766 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm14463-201ENSMUST00000121117 498 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm16458-201ENSMUST00000121428 502 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Tpo-203ENSMUST00000155263 664 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm7244-201ENSMUST00000164658 455 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm17546-201ENSMUST00000168960 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm9890-201ENSMUST00000171867 537 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm26455-201ENSMUST00000175300 92 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm21758-201ENSMUST00000179336 819 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm17786-201ENSMUST00000182000 427 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm28006-201ENSMUST00000183841 122 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm29647-201ENSMUST00000188795 666 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 AV026068-209ENSMUST00000189143 517 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm29051-201ENSMUST00000190184 369 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm28504-201ENSMUST00000190977 666 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm37884-201ENSMUST00000191857 818 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm31511-201ENSMUST00000193134 657 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm35843-201ENSMUST00000193716 666 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm42938-201ENSMUST00000198414 1072 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm6639-204ENSMUST00000199182 800 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Erh-204ENSMUST00000218364 665 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.6 ms