Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Ralyl-203ENSMUST00000171075 1459 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm38697-201ENSMUST00000198061 1746 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
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