Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Mup-ps14-201ENSMUST00000118437 532 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Mup-ps10-201ENSMUST00000119626 556 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm15274-201ENSMUST00000131442 291 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm21979-201ENSMUST00000139887 291 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm15259-201ENSMUST00000151262 291 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 4930515L19Rik-201ENSMUST00000152352 769 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm10269-201ENSMUST00000165229 372 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm28298-201ENSMUST00000185287 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm28127-201ENSMUST00000185293 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm28176-201ENSMUST00000185322 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm29532-201ENSMUST00000185593 622 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm29315-201ENSMUST00000185844 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm29581-201ENSMUST00000186083 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm28296-202ENSMUST00000186151 622 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm29210-201ENSMUST00000186332 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm29498-201ENSMUST00000186449 537 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm28761-201ENSMUST00000186540 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm28170-201ENSMUST00000186892 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm21718-202ENSMUST00000186974 817 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm28326-201ENSMUST00000187043 622 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm28073-201ENSMUST00000187174 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm28725-201ENSMUST00000187372 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm28301-201ENSMUST00000187582 537 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm28464-201ENSMUST00000187726 622 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm29655-201ENSMUST00000187728 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm28280-201ENSMUST00000188196 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm28295-201ENSMUST00000188322 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm28091-201ENSMUST00000188421 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm29215-202ENSMUST00000188659 621 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm28697-202ENSMUST00000188821 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm28521-201ENSMUST00000188948 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm28850-201ENSMUST00000189058 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm28300-202ENSMUST00000189170 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm20776-201ENSMUST00000189940 700 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm28690-202ENSMUST00000190325 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm28456-202ENSMUST00000190521 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm28834-202ENSMUST00000190714 537 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm28325-202ENSMUST00000191481 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm29132-202ENSMUST00000191588 622 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm30174-201ENSMUST00000191682 537 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm36261-201ENSMUST00000191807 537 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm35070-201ENSMUST00000192589 621 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm18382-201ENSMUST00000194394 582 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm34550-202ENSMUST00000195186 537 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm30686-202ENSMUST00000195371 621 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm36467-202ENSMUST00000195606 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 8030487O14Rik-201ENSMUST00000200244 903 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm19039-201ENSMUST00000204363 575 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm44232-201ENSMUST00000204537 225 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 4930402F11Rik-201ENSMUST00000207348 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms