Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm28644-201ENSMUST00000191364 585 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm42610-201ENSMUST00000196557 650 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Obox4-ps4-201ENSMUST00000196934 397 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm44836-201ENSMUST00000205869 336 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm9655-201ENSMUST00000211321 1284 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm17820-201ENSMUST00000220213 1068 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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Cntn3Q07409 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 AC102676.1-201ENSMUST00000228131 719 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Klra7-201ENSMUST00000032286 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Cntn3Q07409 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm22444-201ENSMUST00000093693 108 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Cntn3Q07409 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Rxfp1-201ENSMUST00000078527 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 AC154747.4-203ENSMUST00000225893 1384 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Cntn3Q07409 Fam126b-202ENSMUST00000097724 4581 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Cntn3Q07409 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Cntn3Q07409 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Cntn3Q07409 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Cntn3Q07409 1700040F17Rik-201ENSMUST00000187158 817 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Cntn3Q07409 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm6863-201ENSMUST00000052882 636 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Krtap31-2-201ENSMUST00000058761 935 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm24917-201ENSMUST00000083935 104 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Olfr1170-201ENSMUST00000099831 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm43099-201ENSMUST00000198943 5241 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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