Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Zfp968-203ENSMUST00000131676 1272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 V1rg10-201ENSMUST00000183378 937 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Gm38141-201ENSMUST00000192540 317 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Gm37223-206ENSMUST00000195070 699 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Gm18597-201ENSMUST00000209519 694 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 AC161426.1-201ENSMUST00000214137 286 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Gm40646-201ENSMUST00000218243 490 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 AC102352.1-201ENSMUST00000224187 582 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 AC151984.1-201ENSMUST00000218261 2976 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Mecp2-202ENSMUST00000100750 10538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Kbtbd8-201ENSMUST00000032107 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Etv1-201ENSMUST00000095767 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Kcnk10-202ENSMUST00000221240 7460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Olfr398-202ENSMUST00000117510 5135 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Siah1bQ06985 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Fbxw10-205ENSMUST00000176577 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Siah1bQ06985 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Siah1bQ06985 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Siah1bQ06985 Gm18191-201ENSMUST00000174624 824 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Esp16-201ENSMUST00000178037 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Gm29329-201ENSMUST00000189053 621 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Gm28331-201ENSMUST00000191102 621 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Gm38006-201ENSMUST00000192421 697 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Siah1bQ06985 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms