Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm34768-201ENSMUST00000193884 565 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Lcn12-201ENSMUST00000028312 716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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Hoxd13P70217 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Hoxd13P70217 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Hoxd13P70217 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Hoxd13P70217 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Hoxd13P70217 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
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Hoxd13P70217 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
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Hoxd13P70217 Klra7-203ENSMUST00000088011 921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Olfr1555-ps1-201ENSMUST00000207679 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Igkv4-79-201ENSMUST00000103342 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Anp32-ps-201ENSMUST00000118265 388 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms