Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm38328-201ENSMUST00000195582 317 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm3549-201ENSMUST00000203873 794 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm27617-201ENSMUST00000184321 168 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm27866-201ENSMUST00000184459 171 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Olfr1510-201ENSMUST00000079459 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm44417-201ENSMUST00000203298 3359 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 AC158605.3-201ENSMUST00000218999 2538 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms