Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm13156-201ENSMUST00000118348 321 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm2619-202ENSMUST00000166777 651 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm28122-201ENSMUST00000187088 615 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm28420-201ENSMUST00000187340 615 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm28106-201ENSMUST00000187640 615 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm28698-201ENSMUST00000187734 615 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm29224-201ENSMUST00000187965 615 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm29189-201ENSMUST00000188018 615 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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Sh3bp1P55194 Gm29391-201ENSMUST00000188545 615 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm29280-201ENSMUST00000188571 615 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm28349-201ENSMUST00000188590 615 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm29652-201ENSMUST00000188622 615 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm28819-206ENSMUST00000188816 615 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm29079-201ENSMUST00000188875 615 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm28213-201ENSMUST00000189183 615 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm29382-201ENSMUST00000189549 615 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm29377-205ENSMUST00000189603 615 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm28327-201ENSMUST00000189638 615 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm28790-201ENSMUST00000189642 615 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm28907-201ENSMUST00000189700 615 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm29586-207ENSMUST00000189745 615 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm29115-201ENSMUST00000189870 615 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm28366-201ENSMUST00000190147 615 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm29212-201ENSMUST00000190384 615 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm29533-201ENSMUST00000190403 615 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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Sh3bp1P55194 Gm32180-201ENSMUST00000192415 615 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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Sh3bp1P55194 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Sh3bp1P55194 Vmn1r84-201ENSMUST00000086228 2452 ntAPPRIS P2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Sh3bp1P55194 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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