Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Ttc39d-202ENSMUST00000134652 2438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gcsam-201ENSMUST00000023339 3315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm16294-201ENSMUST00000070382 1459 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Cep57l1-210ENSMUST00000190022 1949 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 AC124426.1-203ENSMUST00000221814 1362 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Olfr381-202ENSMUST00000119863 1065 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm11896-201ENSMUST00000121105 820 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm12735-201ENSMUST00000146218 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm22214-201ENSMUST00000157563 172 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm23027-201ENSMUST00000158771 158 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Ear-ps10-201ENSMUST00000161871 460 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Lgals1-ps2-201ENSMUST00000170221 519 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm42421-201ENSMUST00000172367 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Obox2-203ENSMUST00000174076 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm22646-201ENSMUST00000175130 115 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Vmn1r-ps24-201ENSMUST00000175772 900 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 n-R5s115-201ENSMUST00000179019 119 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Rpl26-ps3-201ENSMUST00000195115 435 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm42489-201ENSMUST00000198964 669 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm9375-201ENSMUST00000208899 903 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm46323-201ENSMUST00000223136 628 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 AC099629.1-201ENSMUST00000226778 464 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 CT030238.3-201ENSMUST00000227352 875 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Tas2r139-201ENSMUST00000057686 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Olfr13-201ENSMUST00000059512 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm4956-201ENSMUST00000082032 1148 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 n-R5s193-201ENSMUST00000082864 109 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Rps12-ps3-201ENSMUST00000086764 494 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Olfr1226-201ENSMUST00000099790 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gpr119-201ENSMUST00000053970 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Plscr2-201ENSMUST00000034932 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Dnajc8-202ENSMUST00000094657 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm36962-201ENSMUST00000192114 1761 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm30400-202ENSMUST00000210562 2115 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Keg1-201ENSMUST00000025598 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
VdrP48281 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 C87499-201ENSMUST00000053304 1901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gc-201ENSMUST00000049209 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 4833407H14Rik-201ENSMUST00000180442 1485 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm6999-201ENSMUST00000180427 2658 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Fam83b-202ENSMUST00000183437 3879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Olfr104-ps-201ENSMUST00000178766 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Ica1l-206ENSMUST00000191251 3415 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Olfr168-202ENSMUST00000213480 2205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Ccdc163-203ENSMUST00000106463 1159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm7091-201ENSMUST00000116438 586 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm16394-201ENSMUST00000117289 675 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm15576-201ENSMUST00000117806 583 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm12604-201ENSMUST00000118382 380 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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