Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Bdnf-209ENSMUST00000111050 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm6185-202ENSMUST00000212885 2692 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Slc12a1-201ENSMUST00000028630 4645 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm42692-201ENSMUST00000199482 2833 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Olfr15-203ENSMUST00000214590 6240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm16086-201ENSMUST00000143652 371 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprkP35822 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprkP35822 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprkP35822 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprkP35822 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprkP35822 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Olfr943-204ENSMUST00000213830 8305 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Zfp652-202ENSMUST00000107717 10433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprkP35822 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprkP35822 B3gnt5-207ENSMUST00000164397 4872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Odf2l-203ENSMUST00000098539 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Olfr12-202ENSMUST00000213247 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm10764-202ENSMUST00000220397 2335 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm12287-201ENSMUST00000119770 707 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm18413-201ENSMUST00000221573 655 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Galnt5-201ENSMUST00000112616 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Ttk-202ENSMUST00000185913 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprkP35822 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Zkscan8-201ENSMUST00000045228 8805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Tecpr2-201ENSMUST00000165978 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Greb1-201ENSMUST00000048064 7940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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PtprkP35822 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm23546-201ENSMUST00000158211 137 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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PtprkP35822 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprkP35822 AC164164.2-201ENSMUST00000221809 785 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprkP35822 AC131178.1-201ENSMUST00000228649 492 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Sptan1-201ENSMUST00000046257 7820 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Myo6-201ENSMUST00000035889 7871 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Shprh-203ENSMUST00000159541 6679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Dlg2-203ENSMUST00000107193 4910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Tsc1-202ENSMUST00000113867 7682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Tsc1-201ENSMUST00000028155 7674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprkP35822 3632451O06Rik-201ENSMUST00000036972 8831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms