Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm18529-201ENSMUST00000193025 1257 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 AC192334.1-201ENSMUST00000221832 1268 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Ptges3-ps-201ENSMUST00000160012 480 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm4831-201ENSMUST00000174626 594 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm2429-201ENSMUST00000194635 586 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Pde6aP27664 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Kcne3-201ENSMUST00000049333 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Olfr1469-201ENSMUST00000077538 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Pde6aP27664 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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Pde6aP27664 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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Pde6aP27664 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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