Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NefhP19246 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NefhP19246 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NefhP19246 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NefhP19246 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NefhP19246 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NefhP19246 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NefhP19246 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NefhP19246 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NefhP19246 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NefhP19246 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NefhP19246 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NefhP19246 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NefhP19246 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NefhP19246 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NefhP19246 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NefhP19246 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NefhP19246 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NefhP19246 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NefhP19246 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NefhP19246 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NefhP19246 Olfr1486-ps1-201ENSMUST00000208835 220 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NefhP19246 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NefhP19246 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NefhP19246 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NefhP19246 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NefhP19246 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NefhP19246 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NefhP19246 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NefhP19246 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NefhP19246 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NefhP19246 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NefhP19246 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NefhP19246 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NefhP19246 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NefhP19246 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NefhP19246 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NefhP19246 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NefhP19246 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NefhP19246 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Gm24382-201ENSMUST00000122698 107 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Gm26169-201ENSMUST00000158420 135 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Gm25246-201ENSMUST00000175476 69 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Gm40987-202ENSMUST00000221856 1588 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NefhP19246 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
NefhP19246 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
NefhP19246 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
NefhP19246 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
NefhP19246 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
NefhP19246 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
NefhP19246 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
NefhP19246 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
NefhP19246 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
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