Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm3183-201ENSMUST00000180076 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Olfr43-202ENSMUST00000205664 2018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 AC122357.1-201ENSMUST00000221652 1515 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm11558-201ENSMUST00000118454 459 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm12889-201ENSMUST00000118684 241 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm13000-201ENSMUST00000120937 496 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm12593-201ENSMUST00000120981 743 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm24592-201ENSMUST00000122505 106 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm2165-201ENSMUST00000124609 1118 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm14553-201ENSMUST00000126711 1118 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm2101-204ENSMUST00000137421 1118 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm3669-205ENSMUST00000144018 1118 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm25770-201ENSMUST00000158566 115 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm24738-201ENSMUST00000158856 123 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm2855-201ENSMUST00000166765 456 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Vmn1r139-202ENSMUST00000173668 753 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm20797-201ENSMUST00000177894 383 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Trav7n-6-201ENSMUST00000178100 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm24417-201ENSMUST00000178123 79 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm6176-201ENSMUST00000178209 906 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm4567-201ENSMUST00000178591 906 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm25934-201ENSMUST00000178642 79 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm10668-201ENSMUST00000179491 906 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm5839-201ENSMUST00000182835 1007 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Txn-ps1-201ENSMUST00000186385 309 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm7436-201ENSMUST00000187229 391 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm4545-201ENSMUST00000190797 603 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm38203-201ENSMUST00000191815 245 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Olfr258-ps1-201ENSMUST00000192471 891 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Ighv1-38-201ENSMUST00000192755 349 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm19035-202ENSMUST00000194575 959 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm42424-201ENSMUST00000198319 376 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
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P10404 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm44448-201ENSMUST00000205104 393 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Thyn1-203ENSMUST00000213770 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Olfr114-202ENSMUST00000214871 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Olfr790-204ENSMUST00000218901 1070 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 AC126554.4-201ENSMUST00000221055 409 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 AC126939.4-201ENSMUST00000225360 743 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Olfr790-201ENSMUST00000056002 1070 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Cxcr6-201ENSMUST00000049810 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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P10404 Gm12289-201ENSMUST00000130860 2235 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Olfr449-202ENSMUST00000204072 1974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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P10404 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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P10404 Gm28832-201ENSMUST00000188603 1498 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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P10404 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm37875-201ENSMUST00000192101 1498 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm37690-202ENSMUST00000192684 1497 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm37462-201ENSMUST00000193386 1498 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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