Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Nlrp12-201ENSMUST00000108653 6928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Ddx5-201ENSMUST00000021062 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Thsd1-202ENSMUST00000160585 3276 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Tbc1d24-214ENSMUST00000201960 4305 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Klhl20-201ENSMUST00000111611 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Ces2c-201ENSMUST00000055052 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Lpin2-204ENSMUST00000129635 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gmfb-202ENSMUST00000111817 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gmfb-201ENSMUST00000079314 4171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm43609-201ENSMUST00000199084 2712 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Iglv2-201ENSMUST00000103752 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Prl-202ENSMUST00000110369 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm14681-201ENSMUST00000118047 411 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Tma7-ps-201ENSMUST00000118448 195 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm12722-201ENSMUST00000118507 493 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm11907-201ENSMUST00000118918 1007 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Fau-ps2-201ENSMUST00000119333 371 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm12607-201ENSMUST00000120724 493 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm23118-201ENSMUST00000122657 187 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm11537-201ENSMUST00000124865 791 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm4660-201ENSMUST00000131499 403 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm15124-201ENSMUST00000142053 953 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm24269-201ENSMUST00000179216 77 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Rpl31-ps21-201ENSMUST00000181182 374 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm29517-201ENSMUST00000190744 351 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm5541-201ENSMUST00000193248 1113 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm37243-201ENSMUST00000193407 595 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Rpl26-ps3-201ENSMUST00000195115 435 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 AC121821.1-201ENSMUST00000199921 111 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Psenen-202ENSMUST00000207031 316 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm6012-201ENSMUST00000210821 730 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 AC090496.1-201ENSMUST00000226020 260 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Ghrh-201ENSMUST00000029172 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Olfr832-201ENSMUST00000060601 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Rpl31-ps4-201ENSMUST00000079114 390 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Adh6a-201ENSMUST00000013455 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 C330007P06Rik-201ENSMUST00000047486 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 AC121860.1-201ENSMUST00000227908 2787 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 C79130-201ENSMUST00000199610 4296 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Snx32-201ENSMUST00000070172 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Thrb-202ENSMUST00000022304 6200 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Lrrc71-201ENSMUST00000023846 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 6330549D23Rik-203ENSMUST00000160818 3228 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Jam2-202ENSMUST00000114195 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Ncaph2-202ENSMUST00000074552 3299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 D030047H15Rik-201ENSMUST00000148318 2536 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm45821-201ENSMUST00000211967 1757 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm38028-201ENSMUST00000193309 2169 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Vmn2r50-201ENSMUST00000074943 2586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Zwilch-201ENSMUST00000122091 2957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Cacna1c-206ENSMUST00000185345 6579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Slc2a9-202ENSMUST00000067872 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Lrba-201ENSMUST00000107635 9888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 AC113304.1-201ENSMUST00000214014 1833 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm5535-208ENSMUST00000210482 1403 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Inpp5k-201ENSMUST00000006286 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Nbr1-206ENSMUST00000107213 4339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Ccdc187-202ENSMUST00000217256 9411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gtf2a1-201ENSMUST00000021345 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Myo18a-209ENSMUST00000108376 7374 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Caps2-203ENSMUST00000170013 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Ctnnd1-218ENSMUST00000111692 6170 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Crispld1-201ENSMUST00000095075 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 4933431E20Rik-210ENSMUST00000152663 2358 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Sema6a-203ENSMUST00000115449 6815 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Oprl1-202ENSMUST00000108763 2971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm20589-201ENSMUST00000204099 2530 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 D230017M19Rik-203ENSMUST00000181973 1649 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Col4a5-201ENSMUST00000112930 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Mtbp-204ENSMUST00000169667 2570 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm26802-201ENSMUST00000181066 2144 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Rnf122-201ENSMUST00000046941 3582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Sorbs2-222ENSMUST00000141039 1699 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 A630001O12Rik-201ENSMUST00000212914 2182 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm31983-202ENSMUST00000210553 3155 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Slc26a8-201ENSMUST00000114764 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm44848-201ENSMUST00000207808 3234 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms