Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
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H2-Q1O19441 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
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H2-Q1O19441 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
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H2-Q1O19441 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
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H2-Q1O19441 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
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H2-Q1O19441 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
H2-Q1O19441 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
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H2-Q1O19441 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
H2-Q1O19441 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
H2-Q1O19441 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
H2-Q1O19441 AC132121.1-201ENSMUST00000220774 332 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
H2-Q1O19441 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
H2-Q1O19441 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
H2-Q1O19441 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
H2-Q1O19441 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms