Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 AC131586.2-202ENSMUST00000227016 2705 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Gm24142-201ENSMUST00000101960 107 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Gm15230-201ENSMUST00000153701 510 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Vmn1r-ps67-201ENSMUST00000173843 691 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Gm18445-201ENSMUST00000195502 774 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp35M0QWN7 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms