Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Defa-ps10-201ENSMUST00000121649 171 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm15792-201ENSMUST00000137099 769 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm26355-201ENSMUST00000158220 105 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm29815-201ENSMUST00000202418 178 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm19056-201ENSMUST00000218220 797 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 AC155270.1-202ENSMUST00000221503 352 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 CT030238.3-201ENSMUST00000227352 875 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm9958-201ENSMUST00000068250 1284 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Tas2r102-201ENSMUST00000069268 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Olfr618-201ENSMUST00000098197 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm10780-201ENSMUST00000099459 285 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm19757-201ENSMUST00000205113 2946 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Ifna14-201ENSMUST00000102808 570 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Ighv1-84-201ENSMUST00000103551 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Trdv4-201ENSMUST00000103679 444 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm14904-201ENSMUST00000117067 335 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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Cldn34c3J3QJW5 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm44332-201ENSMUST00000203712 433 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm33248-201ENSMUST00000205836 617 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm8804-201ENSMUST00000212292 798 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.3 ms