Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Olfr1132-201ENSMUST00000090711 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Olfr48-202ENSMUST00000214428 3848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 AC158525.1-201ENSMUST00000223806 576 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Olfr1305-201ENSMUST00000099608 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Taf1-206ENSMUST00000149274 5954 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm28231-201ENSMUST00000190118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gcc2-201ENSMUST00000057659 6547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm8061-201ENSMUST00000122380 350 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Ccdc162-210ENSMUST00000189488 7260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm17137-201ENSMUST00000164106 4371 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm831-201ENSMUST00000149942 4517 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 E030022I16Rik-201ENSMUST00000215131 2766 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Sim1-201ENSMUST00000020071 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Srpk2-201ENSMUST00000088392 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms