Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm24272-201ENSMUST00000102329 98 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Cnga3Q9JJZ8 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Homer1-205ENSMUST00000109492 1533 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Cnga3Q9JJZ8 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Cnga3Q9JJZ8 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Cnga3Q9JJZ8 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm8919-201ENSMUST00000182028 1014 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm29007-201ENSMUST00000190633 679 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Cnga3Q9JJZ8 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms