Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Fam49a-205ENSMUST00000223061 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Igkv8-30-201ENSMUST00000103378 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6490-201ENSMUST00000111862 461 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Tmsb4x-203ENSMUST00000112176 698 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13311-201ENSMUST00000117863 379 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24893-201ENSMUST00000122745 369 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm23639-201ENSMUST00000175078 132 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm22646-201ENSMUST00000175130 115 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20625-201ENSMUST00000177065 698 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Hist2h2bb-201ENSMUST00000177113 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5798-202ENSMUST00000179987 582 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Pkia-203ENSMUST00000193330 631 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8921-201ENSMUST00000204306 649 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7045-201ENSMUST00000221466 605 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 AC157650.2-201ENSMUST00000224666 328 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr715-201ENSMUST00000076958 1131 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Scgb1b27-201ENSMUST00000085618 493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Scn8a-202ENSMUST00000096198 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Acsm3-203ENSMUST00000106527 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Ms4a7-201ENSMUST00000025574 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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Gtf3c6Q9D8P7 Olfr930-202ENSMUST00000217208 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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Gtf3c6Q9D8P7 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 P2ry14-205ENSMUST00000197220 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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Gtf3c6Q9D8P7 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Gtf3c6Q9D8P7 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Gtf3c6Q9D8P7 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11880-201ENSMUST00000117612 399 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13006-201ENSMUST00000118683 214 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28285-204ENSMUST00000187793 601 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28535-201ENSMUST00000188069 885 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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