Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 AC121844.3-201ENSMUST00000219124 1785 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm26959-201ENSMUST00000182376 978 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm28501-201ENSMUST00000188729 421 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Acsl4-204ENSMUST00000112907 5137 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm12185-202ENSMUST00000094476 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm8267-203ENSMUST00000226900 1592 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Skint5-204ENSMUST00000171627 1611 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm25760-201ENSMUST00000103989 132 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm14904-201ENSMUST00000117067 335 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm13423-201ENSMUST00000117205 888 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm14156-201ENSMUST00000121538 483 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Mir1981-201ENSMUST00000157934 82 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm28087-201ENSMUST00000189195 767 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Dcp2-202ENSMUST00000202306 398 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm45405-201ENSMUST00000211544 609 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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Rprd1bQ9CSU0 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 AC166323.1-201ENSMUST00000217756 367 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm19056-201ENSMUST00000218220 797 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 CT009539.1-201ENSMUST00000226465 220 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Bglap3-201ENSMUST00000075523 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm18908-201ENSMUST00000207125 1483 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r34-206ENSMUST00000228498 3078 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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