Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm28885-201ENSMUST00000185615 563 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm44091-201ENSMUST00000205212 649 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm11902-201ENSMUST00000118849 270 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm27468-201ENSMUST00000183577 106 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm4083-201ENSMUST00000207158 451 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 AC131029.2-201ENSMUST00000226696 628 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm25133-201ENSMUST00000082647 130 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms