Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm1141-201ENSMUST00000101495 2147 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 3100003L05Rik-201ENSMUST00000130240 664 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 4930513N10Rik-202ENSMUST00000132616 490 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 AC124414.1-201ENSMUST00000218033 2946 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Olfr566-203ENSMUST00000213481 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm12066-201ENSMUST00000123592 443 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm26557-201ENSMUST00000180756 493 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Ighv5-5-201ENSMUST00000193826 329 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm44892-201ENSMUST00000208595 488 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Akt3-201ENSMUST00000019843 1511 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm24682-201ENSMUST00000158764 137 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm2619-202ENSMUST00000166777 651 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.5 ms