Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Olfr1305-201ENSMUST00000099608 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Olfr1340-202ENSMUST00000213436 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Arfgef3-202ENSMUST00000215836 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Olfr15-202ENSMUST00000214238 6135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm42837-201ENSMUST00000197071 2829 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm40987-202ENSMUST00000221856 1588 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Erbin-203ENSMUST00000091269 6224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm13772-201ENSMUST00000118431 317 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm17934-201ENSMUST00000192818 422 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Olfr481-201ENSMUST00000067143 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm10822-201ENSMUST00000181596 2320 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Map1b-201ENSMUST00000064762 11808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Spata3-203ENSMUST00000125083 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 CAAA01125382.4-201ENSMUST00000217222 774 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Ceacam1-203ENSMUST00000098669 2873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Ccnb2-ps-202ENSMUST00000170898 2296 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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