Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm38263-201ENSMUST00000195879 3059 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Kmo-201ENSMUST00000040250 2695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm25971-201ENSMUST00000158953 286 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Vmn1r227-202ENSMUST00000179914 1026 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Mir6244-201ENSMUST00000184156 117 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm18547-201ENSMUST00000192439 811 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm44232-201ENSMUST00000204537 225 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 AC153821.1-201ENSMUST00000217893 581 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 AC153370.1-201ENSMUST00000220296 635 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 AC134335.1-201ENSMUST00000227626 329 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Olfr273-201ENSMUST00000051520 1059 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Olfr633-201ENSMUST00000098188 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxa13Q62424 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm16204-201ENSMUST00000117864 1897 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm6620-201ENSMUST00000120113 715 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm4831-201ENSMUST00000174626 594 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms