Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm43387-201ENSMUST00000196896 1066 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm44786-201ENSMUST00000208165 1008 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm45666-201ENSMUST00000211474 277 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 AC153845.1-201ENSMUST00000213596 428 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 AC154747.4-201ENSMUST00000224802 903 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Cst13-201ENSMUST00000046589 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Olfr761-201ENSMUST00000049620 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Olfr127-201ENSMUST00000076331 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm44144-201ENSMUST00000203683 1960 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Med13-201ENSMUST00000043624 10546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 AC124569.3-201ENSMUST00000224860 1621 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm29592-201ENSMUST00000189434 370 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm42428-201ENSMUST00000198677 302 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm35998-201ENSMUST00000212862 838 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Clpsl2-201ENSMUST00000025061 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm9837-201ENSMUST00000057722 731 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Mir24-2-201ENSMUST00000083607 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Olfr586-201ENSMUST00000084811 954 ntAPPRIS P2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1138-201ENSMUST00000099848 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Fat1-201ENSMUST00000098796 14627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Ptprq-201ENSMUST00000050702 7393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 AC159624.1-201ENSMUST00000217762 1344 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms