Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Olfr1288-201ENSMUST00000104889 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm13423-201ENSMUST00000117205 888 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Vmn1r116-201ENSMUST00000164288 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Vmn1r152-201ENSMUST00000168326 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Vmn1r95-201ENSMUST00000168984 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Vmn1r104-201ENSMUST00000169689 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Vmn1r143-201ENSMUST00000171622 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm4831-201ENSMUST00000174626 594 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm18984-201ENSMUST00000193998 1124 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm43093-201ENSMUST00000202439 1213 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm3549-201ENSMUST00000203873 794 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 4930402F11Rik-202ENSMUST00000207781 1178 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Olfr1244-ps1-201ENSMUST00000213226 683 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Olfr206-201ENSMUST00000084791 1005 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Olfr740-201ENSMUST00000089838 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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