Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Ttc39dQ0VF76 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Ttc39dQ0VF76 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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Ttc39dQ0VF76 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Ttc39dQ0VF76 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm8479-201ENSMUST00000203825 718 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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Ttc39dQ0VF76 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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Ttc39dQ0VF76 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Ttc39dQ0VF76 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Ttc39dQ0VF76 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Ttc39dQ0VF76 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Ttc39dQ0VF76 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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Ttc39dQ0VF76 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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Ttc39dQ0VF76 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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Ttc39dQ0VF76 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
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Ttc39dQ0VF76 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm12800-201ENSMUST00000075999 1455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms