Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Gm12066-201ENSMUST00000123592 443 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Gm22711-202ENSMUST00000197029 135 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Gm13724-201ENSMUST00000122395 1155 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Gm12929-201ENSMUST00000122406 370 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Gm19764-201ENSMUST00000203630 649 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Gm30340-201ENSMUST00000191898 2198 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Gjb2Q00977 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Gjb2Q00977 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
Gjb2Q00977 Fam90a1b-203ENSMUST00000113903 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gjb2Q00977 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gjb2Q00977 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gjb2Q00977 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gjb2Q00977 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gjb2Q00977 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gjb2Q00977 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gjb2Q00977 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gjb2Q00977 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Gjb2Q00977 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Gjb2Q00977 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gjb2Q00977 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gjb2Q00977 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gjb2Q00977 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.9 ms