Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm10568-201ENSMUST00000193244 1634 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm44144-201ENSMUST00000203683 1960 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Tex35-202ENSMUST00000118207 912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm8288-201ENSMUST00000223406 593 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm9408-201ENSMUST00000197375 1505 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Olfr584-202ENSMUST00000214215 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm43062-201ENSMUST00000196302 1319 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Slco6d1-201ENSMUST00000027575 2328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Spata17-202ENSMUST00000110945 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm38030-201ENSMUST00000192376 475 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm44176-201ENSMUST00000204336 276 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Phf11d-201ENSMUST00000095157 2666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm43319-201ENSMUST00000198036 2270 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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