Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm14824-201ENSMUST00000119421 737 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm13224-201ENSMUST00000119586 94 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm11512-201ENSMUST00000119669 663 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Rps25-ps1-201ENSMUST00000119876 378 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps3-201ENSMUST00000122439 917 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm14329-201ENSMUST00000136027 591 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm13180-201ENSMUST00000141222 440 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm11551-201ENSMUST00000147438 410 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm23505-201ENSMUST00000158989 130 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm10804-202ENSMUST00000162565 867 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm6647-201ENSMUST00000170514 641 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Znrf1-210ENSMUST00000173781 337 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm20456-201ENSMUST00000174690 385 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 4930426I24Rik-201ENSMUST00000180709 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm5181-201ENSMUST00000183140 971 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm28869-201ENSMUST00000187199 811 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm28285-204ENSMUST00000187793 601 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm37209-201ENSMUST00000194109 1276 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm37729-201ENSMUST00000194761 1172 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm37871-201ENSMUST00000194973 688 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 AF067063-202ENSMUST00000195234 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm43384-201ENSMUST00000200569 637 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm44129-201ENSMUST00000203511 675 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm18855-201ENSMUST00000206689 570 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Olfr485-201ENSMUST00000208296 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm5086-203ENSMUST00000210897 1136 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm45400-201ENSMUST00000211603 653 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 AC091260.1-201ENSMUST00000216112 229 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm40853-201ENSMUST00000221342 582 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 AC134468.2-202ENSMUST00000222820 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm9255-201ENSMUST00000223225 581 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 AC154785.1-201ENSMUST00000223280 572 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Tex37-201ENSMUST00000063456 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Olfr220-201ENSMUST00000085861 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm40778-201ENSMUST00000217825 1344 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Ikbkg-206ENSMUST00000114130 6736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Usp50-201ENSMUST00000028842 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Efcab5-201ENSMUST00000108400 4654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm44104-201ENSMUST00000204736 3777 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm8127-201ENSMUST00000163655 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Rassf6-206ENSMUST00000202784 1919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Cdk1-201ENSMUST00000020099 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm45352-201ENSMUST00000210140 1452 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Hipk1-202ENSMUST00000106845 3967 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm11934-201ENSMUST00000132553 1536 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
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Hoxd9P28357 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Cd38-201ENSMUST00000030964 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Siae-204ENSMUST00000215474 4947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Dnah9-201ENSMUST00000080665 13798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm43534-201ENSMUST00000197685 2853 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Chrm2-202ENSMUST00000172278 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm1587-201ENSMUST00000100372 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm23133-201ENSMUST00000104255 135 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm22152-201ENSMUST00000116966 125 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Mir669e-201ENSMUST00000117003 119 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm11488-201ENSMUST00000117277 863 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Defa-ps1-201ENSMUST00000119062 282 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm14450-201ENSMUST00000119984 240 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Defa-ps6-201ENSMUST00000122172 282 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Babam2-205ENSMUST00000131995 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm8093-203ENSMUST00000144982 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Mllt3-207ENSMUST00000148059 422 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm22755-201ENSMUST00000157143 100 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm3339-201ENSMUST00000163462 475 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 1700071M16Rik-201ENSMUST00000164150 537 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm3298-201ENSMUST00000165289 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
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