Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm4410-201ENSMUST00000199349 686 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Clec2g-205ENSMUST00000203405 967 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm5655-201ENSMUST00000221078 901 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Mllt10-202ENSMUST00000114669 3865 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Mndal-201ENSMUST00000111210 1907 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm15933-201ENSMUST00000117215 616 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm17091-201ENSMUST00000163248 357 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Scgb1b10-201ENSMUST00000187257 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Tshb-206ENSMUST00000200041 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 4930401A07Rik-201ENSMUST00000214657 746 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 AC139294.2-201ENSMUST00000227159 285 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 AC154368.2-201ENSMUST00000222334 1724 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Olfr26-201ENSMUST00000104874 931 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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