Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P18530 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P18530 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P18530 Gm25989-201ENSMUST00000158761 133 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P18530 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P18530 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P18530 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P18530 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P18530 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P18530 Mir7058-201ENSMUST00000184637 75 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P18530 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P18530 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P18530 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P18530 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P18530 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P18530 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P18530 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P18530 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P18530 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P18530 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P18530 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P18530 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P18530 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P18530 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P18530 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P18530 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P18530 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P18530 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P18530 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P18530 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P18530 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P18530 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P18530 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P18530 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P18530 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P18530 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P18530 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P18530 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Gm37871-201ENSMUST00000194973 688 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Gm45345-201ENSMUST00000211427 555 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 AC137950.3-201ENSMUST00000228250 246 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P18530 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms