Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Mrpl48-ps-201ENSMUST00000121413 636 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Dcp2-202ENSMUST00000202306 398 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm35521-201ENSMUST00000211285 440 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Olfr535-201ENSMUST00000074897 991 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm38697-201ENSMUST00000198061 1746 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm7599-201ENSMUST00000121453 796 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 0610006L08Rik-202ENSMUST00000206672 803 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Olfr1510-201ENSMUST00000079459 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
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