Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm44694-201ENSMUST00000205317 1298 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 AC105324.1-201ENSMUST00000227844 386 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Ptpn9O35239 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Ptpn9O35239 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Ptpn9O35239 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Ptpn9O35239 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Ptpn9O35239 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Ptpn9O35239 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Ptpn9O35239 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ptpn9O35239 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 221.1 ms