Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gm42421-201ENSMUST00000172367 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gm27186-201ENSMUST00000184223 307 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gm37871-201ENSMUST00000194973 688 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gm21048-201ENSMUST00000202470 1166 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gm37079-201ENSMUST00000194114 2135 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Mndal-201ENSMUST00000111210 1907 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Pole2-202ENSMUST00000221411 1641 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gm13724-201ENSMUST00000122395 1155 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm21411J3KMS0 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms