Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm14728-201ENSMUST00000122196 492 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Nrbf2-202ENSMUST00000159002 583 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Lrmda-206ENSMUST00000162540 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm32899-201ENSMUST00000219694 207 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Olfr586-201ENSMUST00000084811 954 ntAPPRIS P2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Olfr357-202ENSMUST00000213218 5367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Dcun1d1-212ENSMUST00000198389 3020 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm13311-201ENSMUST00000117863 379 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm11761-201ENSMUST00000121392 445 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Mir5100-201ENSMUST00000174993 64 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm32507-201ENSMUST00000209552 437 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 AC132384.8-201ENSMUST00000218152 1204 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 AC118230.1-201ENSMUST00000220196 656 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm40271-201ENSMUST00000221752 422 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Lats2-203ENSMUST00000077981 786 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms