Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Gm24682-201ENSMUST00000158764 137 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Cntn4-204ENSMUST00000113260 2531 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rpa3Q9CQ71 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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