Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Nxf1-205ENSMUST00000183939 1017 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm9989-202ENSMUST00000193125 258 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm37425-201ENSMUST00000193184 432 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm43590-201ENSMUST00000195987 387 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm42509-201ENSMUST00000197390 781 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm31532-201ENSMUST00000203555 767 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 AC133948.2-201ENSMUST00000217850 378 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 7420701I03Rik-201ENSMUST00000222157 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 AC140210.1-201ENSMUST00000224961 534 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 AC102815.1-201ENSMUST00000226662 1061 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Cldn10-202ENSMUST00000071546 1031 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm24035-201ENSMUST00000082867 107 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm14849-201ENSMUST00000122293 2846 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r89-205ENSMUST00000227276 1417 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Tmem175-201ENSMUST00000063272 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Trbv19-201ENSMUST00000103276 566 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm13988-201ENSMUST00000119363 288 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm12287-201ENSMUST00000119770 707 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Wdr83os-202ENSMUST00000140621 630 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm27155-201ENSMUST00000183716 898 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Mir6357-201ENSMUST00000184246 104 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Snhg14-204ENSMUST00000185890 756 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm28384-201ENSMUST00000189079 463 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm29051-201ENSMUST00000190184 369 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm37729-201ENSMUST00000194761 1172 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm17660-203ENSMUST00000198485 522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 2900060B14Rik-201ENSMUST00000203191 616 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm43926-201ENSMUST00000203978 430 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Hba-x-201ENSMUST00000020531 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm18877-201ENSMUST00000207706 539 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Lyrm1-209ENSMUST00000208424 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm18338-201ENSMUST00000222381 560 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 AC124687.3-201ENSMUST00000222865 875 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Olfr670-201ENSMUST00000050482 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm5815-201ENSMUST00000050706 1185 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm7493-201ENSMUST00000085919 626 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Tnfaip6-201ENSMUST00000065927 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm37940-201ENSMUST00000194243 3251 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm14727-201ENSMUST00000118526 525 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm15665-201ENSMUST00000119116 847 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm12944-201ENSMUST00000119262 463 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms