Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Akt3-201ENSMUST00000019843 1511 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11848-201ENSMUST00000121207 973 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26169-201ENSMUST00000158420 135 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29240-201ENSMUST00000187248 286 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 AC102139.1-201ENSMUST00000227000 251 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr982-201ENSMUST00000054051 5576 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm30340-201ENSMUST00000191898 2198 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Mxi1-203ENSMUST00000111737 4843 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Mms19-217ENSMUST00000171561 6607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 CT009480.1-201ENSMUST00000225771 4480 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10860-201ENSMUST00000176934 1888 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29446-201ENSMUST00000190887 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26659-201ENSMUST00000181816 3655 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Btk-201ENSMUST00000033617 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Fam90a1b-203ENSMUST00000113903 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms