Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gpr87-203ENSMUST00000200095 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Herc2-202ENSMUST00000164095 15261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Cntnap5c-201ENSMUST00000076038 3931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r115-201ENSMUST00000168175 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm15778-201ENSMUST00000118469 608 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm8916-201ENSMUST00000119732 949 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm15081-201ENSMUST00000119794 844 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm11203-201ENSMUST00000122169 741 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm12525-201ENSMUST00000125412 554 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm20638-201ENSMUST00000175796 550 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm3383-203ENSMUST00000178414 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm3194-201ENSMUST00000180143 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm26579-201ENSMUST00000181656 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm5920-201ENSMUST00000187390 853 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 4930565D16Rik-201ENSMUST00000192777 1112 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm17660-203ENSMUST00000198485 522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm18060-201ENSMUST00000207407 564 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm29154-253ENSMUST00000217229 1207 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Cfap126-201ENSMUST00000027959 1034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Rpl27a-ps1-201ENSMUST00000075382 448 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Olfr33-201ENSMUST00000084817 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1308-201ENSMUST00000099605 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1247-201ENSMUST00000099771 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm38195-201ENSMUST00000194247 1499 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Lair1-203ENSMUST00000086401 2496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Dcun1d1-212ENSMUST00000198389 3020 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-59-201ENSMUST00000103530 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm15049-201ENSMUST00000120474 463 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm5135-201ENSMUST00000121100 573 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm15362-201ENSMUST00000121459 388 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm14830-201ENSMUST00000121899 700 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm7502-201ENSMUST00000169235 733 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm26197-201ENSMUST00000175033 115 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Mir6974-201ENSMUST00000184381 83 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Txn-ps1-201ENSMUST00000186385 309 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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