Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Galntl6-205ENSMUST00000188531 1056 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm6197-201ENSMUST00000192273 454 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm22711-202ENSMUST00000197029 135 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Igkv13-61-1-201ENSMUST00000198255 296 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm37797-201ENSMUST00000212114 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm6667-201ENSMUST00000217169 564 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 AC147245.1-201ENSMUST00000223294 677 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 AC161877.2-201ENSMUST00000226248 545 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Odf3l1-201ENSMUST00000055036 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm7099-201ENSMUST00000080066 554 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Sult2a3-201ENSMUST00000098809 1018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm15731-201ENSMUST00000146887 2195 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm3867-202ENSMUST00000181639 2007 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm25757-201ENSMUST00000103986 123 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm12590-201ENSMUST00000134226 404 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm13219-202ENSMUST00000152599 685 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm26046-201ENSMUST00000157312 166 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Cldn34c1-206ENSMUST00000169445 705 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Cldn34c3-201ENSMUST00000178148 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm29999-202ENSMUST00000193554 671 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm18428-201ENSMUST00000194986 791 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Mrpl24-201ENSMUST00000019854 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm44726-201ENSMUST00000203427 217 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm7639-201ENSMUST00000212608 484 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 AC102582.1-201ENSMUST00000215376 378 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm18510-201ENSMUST00000219335 1096 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 4930503E24Rik-202ENSMUST00000219657 942 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 AC165287.1-201ENSMUST00000224985 178 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 CT025548.1-201ENSMUST00000227459 257 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 AC125523.1-201ENSMUST00000228018 934 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Cep170-201ENSMUST00000057037 6930 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 C2cd3-202ENSMUST00000098259 6602 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms